Μετά από 30 σχεδόν χρόνια στα Εξάρχεια ―πρώτα στην οδό Μάνης κι έπειτα στην οδό Κλεισόβης― οι Πανεπιστημιακές Εκδόσεις Κρήτης μετακόμισαν, την άνοιξη του 2016, στο νέο τους κτήριο στην Αθήνα, στην οδό Θουκυδίδου 4 στην Πλάκα. Στο νεοκλασικό κτήριο των αρχών του 20ού αιώνα λειτουργεί το νέο βιβλιοπωλείο των ΠΕΚ και στεγάζονται τα γραφεία του εκδοτικού τμήματος, του εμπορικού τμήματος και του τμήματος επικοινωνίας στην Αθήνα. Στον χώρο διοργανώνονται εκδηλώσεις, φιλοξενούνται σεμινάρια και workshop, ενώ επίσης λειτουργεί το στούντιο του Mathesis στην Αθήνα.